تتلخص مهام إدارة مشاريع المنشآت المائية في :                                         
1. الاشراف على تنفيذ مجمعات توزيع المياه وما يتصل بها من أعمال مدنية ومعمارية وميكانيكية وكهربائية مع توريد وتركيب أجهزة المراقبة والتحكم وأجهزة الإتصالات وأنظمة الحريق والأمن والسلامة .
2. وكذلك الأشراف على تنفيذ مشاريع إنشاء وإنجاز وصيانة خزانات المياه الأرضية بسعاتها المختلفة وأبراج المياه العلوية ومحطات الضخ وخطوط أنابيب المياه من حديد الدكتايل أو الأنابيب الفولاذية ومحطات تعبئة المياه في مناطق متفرق من البلاد .
3. وتشارك إدارة مشاريع المنشاًت المائية في دراسة عروض المناقصات وترسيتها والأشراف على تنفيذ هذه الأعمال ودراسة ما يتقدم به المقاولون من أقتراحات والرد عليها حتى يتم أستلام تلك العمال كاملة من المقاولين طيقا لشروط ومواصفات كل عقد على حدة ، ومن ثم تسليمها للقسم أو الأدارة المعنية بالوزارة للأستفادة منها بالخدمة والمحافظة على استمرارية تشغيلها ومتابعة حالة تلك الأعمال خلال مدة الصيانة حتى أصدار شهادة  أتما العقد النهائية .
وفيما يلي وصف للمشاريع التي تقوم الأدارة بالأشراف على تنفيذها ولإختصاص الإدارة وهي كما يلي :
• إنشاء مجمعات ضخ وتوزيع المياه وتشمل عدد من الخزانات الأرضية ذات سعات كبيرة تترواح ما بين ( 35  –    101 ) مليون جالون لكل خزان وما يتبع ذلك من خطوط دخول وخروج المجمعات والخزانات من حديد الدكتايل وباقطارمختلفة حتى 1600 مم مع إنشاء خطوط الصرف والغسيل والفائض وما يتصل بها من ملحقات مثل مباني أو غرف للتحكم والمحابس الكهربائية لعمليات التشغيل .
• إنشاء محطات ضخ المياه والتدوير للمحافظة على صلاحية المياه للآستهلاك الآدمي وإنشاء محطات الخلط للمياه وكذلك محطات معالجة المياه والمختبرات الكيميائية اللازمه لها .
• إنشاء خزانات مياه أرضية ذات سعات مختلفة في أماكن مختلفة من البلاد وتشمل خزانات ذات سعات تصل إلى ( 55 ) مليون جالون .
• إنشاء أبراج المياه العلوية ذات سعات مختلفة مع ما يلزمها من أجهزة قياس وتحكم ومعالجة وخطوط دخول وخروج المياه العذبة وقليلة الملوحة إلى خطوط الصرف وجميع الخدمات التابعة لها .
• إنشاء محطات ضخ المياه الرئيسية وتوابعها .
• إنشاء خطوط المياه الرئيسية من حديد الدكتايل باقطار حتى 1200  مم وشبكات تجميع المياه قليلة الملوحة لحقول آبار المياه الجوفية .
• إنشاء الأعمال المدنية والمعمارية التالية :
o صبات خرسانية وأسوار وغرف كهربائية لآبار المياه الجوفية .
o ورش ومنشآت لادارة المياه الجوفية .
o أسوار حول مجمعات توزيع المياه الارضية والعلوية مع المستودعات  وأبراج وغرف الحراسة وساحات خرسانية .
• تدقيق وحصر كميات الأعمال المنجزة للمقاولين وأعتماد الدفعات المرحلية وإعداد وإعتماد الحساب الختامي لكافة العقود .
• دراسة مطالبات المقاولين المالية والرد عليها ودراسة برنامج العمل لكافة العقود .
• إصدار لوائح العمل للمواد التي يتم صرفها من مخازن الوزارة ومراقبة أعمال صرف المواد وتشوينها بالموقع .
• دراسة وإعتماد المواد التي يتم توريدها من قبل المقاولين لكافة العقود .
• متابعة أعمال السلامة العامة لاعمال الحفر والتمديد واللحام والانشاء بالمراحل المختلفة لكل شروع .
• المشاركة بلجان الأستلام والتوصية بإصدار شهادات الأستلام والقبول وشهادات أتمام العقد لكافة العقود.
• دراسة أية تعديلات فنية أثناء التنفيذ وأتخاذ اللأزم لمصلحة العمل في كافة العقود .
• التنسيق مع كافة الإدارات المختصة المعنية داخل وخارج الوزارة لتنفيذ كافة الأعمال المطلوبة على أكمل وجه .
مراقبة الإشراف والتدقيق على الأعمال الكهربائية والتحكم :
• متابعة الأعمال بمواقع العمل حسب برنامج العمل المعتمد والتأكد من تطبيق المقاولين للمواصفات الفنية.
• التنسيق مع إدارة تشغيل وصيانة المنشآت المائيـة وادارة تشغيل وصيانة الشبكات المائية .
• التنسيق مع ادارة الخدمات الفنية وادارة التمديدات الكهربائية بشأن اعتماد المخططات الكهـربائية وتطبيق المواصفـات الاشتراطـات الفنيـة لهاتين الإدارتين .
• التنسيق مـع الادارات المعنية بالـوزارة فـي حالة توريد وتركيب مولدات ديزل .
• متابعة اعمال حصر الكميات لبنود أعمال الكهرباء والتحكم واعتماد الدفعات المرحلية والحساب الختامي للمقاولين .
• متابعة ودراسة حدوث أية تعديلات فنية أثناء التنفيذ .
• المشاركة في لجان الاستلام لاعمال الكهرباء والتحكم والتوصية بإصدار شهادة الاستلام والقبول لهذه العمال في نهاية المشروع .
• دراسة المطالبات المالية الخاصة باعمال الكهرباء والتحكم التى يتقدم بها المقاولين أثناء التنفيذ والرد عليها . 
مراقبة التنفيذ :
• متابعة الأعمال بمواقع العمل حسب برنامج العمل المعتمد والتأكد من تطبيق المقاولين للمواصفات حسب الشروط والمخططات لكافة الأعمال الميكانيكية والمدنية .
• متابعة أعمال استلام المواد من مخازن الوزارة وتشوينها بمواقع العمل بصورة سليمة وآمنة حسب الشروط والمواصفات .
• القيام بالدراسة اللازمة والتوصية بالموافقة الاولية علـى اعتماد المـواد التي يقوم المقاولين بتوريدها بمواقع العمل ومتابعة استلام وفحص هـذه المواد بعد التوريد بالتنسيق مـع مهندس المـواد المختص بإدارة تصميم مشاريع الشبكات والمنشآت المائية .
• التنسيق مـع ادارة تشغيل وصيانـة الشبكات المـائية وإدارة الأعمـال الكيماوية أثناء العمل .
• التنسيق مع ادارة تشغيل وصيانة المنشآت المائية أثناء العمل .
• التنسيق مع ادارة مشاريع المياه الجوفية وادارة أنتاج المياه الجوفية في حالات إنشاء غرف آبار أو أنشاء شبكة تجميع مياه الآبار في حالات مشاريع حقول المياه الجوفية وإنشاء الخزانات الأرضية للمياه قليل الملوحة .
• التنسيق مع مراقب خدمات المياه المختص بادارة تصميم مشاريع الشبكات والمنشآت فـي حالات التعارض أو وجـود عقبات بالطبيعة تعترض التنفيذ بالمسارات المخصصة للمياه بكافة مواقع العمـل ، وبالتنسيق مع مهندسي العقود المختلفة .
• التنسيق مع كافة الجهات الأخرى الحكومية مثل البلدية وغيرها في حالات التعارض أو وجـود عقبات بالطبيعة تعترض التنفيذ بالمسارات المخصصة للمياه بكافة بمواقع العمل ، وبالتنسيق مع مهندسي العقود المختلفة .
• التأكد من تطبيق شروط السلامة لعمليات الحفر واللحام والتمديد بمواقع العمل .
• متابعة أعمال حصر الكميات لبنود الحفر والتمديد وتدقيق وأعتماد كميات الاعمال المنجزة للدفعات المرحلية والحساب الختامي .
• المشاركة في لجان الاستلام والتوصية باصدار شهادات الاستلام والقبول وشهادات اتمام العقد بعد انتهاء مدة الصيانة حسب الشروط والمواصفات.
• التنسيق مع مراقب الاعمال المدنية والميكانيكية في بنود العمال المشتركة أثناء بمواقع العمل .
مراقبة الاشراف والتدقيق على الأعمال المدنية والميكانيكية :
• متابعة الأعمـال بمواقـع العمل حسب برنامج العمـل المعتمد والتأكد من تطبيق المقاولين للمواصفـات الفنيـة حسب الشروط والمخططات لكافـة الأعمال المعمارية والمدنية والميكانيكية .
• متابعة اعمال فحص المكعبات بالمواقع .
• متابعة أعمال تشوين وتوريد المواد بالمواقع وأعمال السلامة .
• متابعة أعتماد المخططات التنفيذية للأعمال المدنية والميكانيكية والتنسيق مع الجهات الأخرى لخدمات الكهربـاء والتحكم الآلى والصـرف الصحي وصرف الأمطار وأنارة الشوارع والهاتف وغير ذلك من الأعمال .
• التنسيق مع إدارة تشغيل وصيانة المنشآت المائية قبل وأثناء العمل .
• التنسيق مع الأعمال الكيماوية وتشغيل وصيانة الشبكات المائية أثناء التنفيذ .
• التنسيق مع إدارة محطات تعبئة المياه بالنسبة لمشاريع محطات التعبئة.
• أعداد ومراجعة الدفعات الشهرية المقدمة من قبل المقاولين وأعتمادها وأعداد الحساب الختامي .
• التوصية بتشكيل لجان الأستلام والمشاركة فيها أثناء الأستلام واصدار شهادات الأستلام والقبول لاعمال العقود المنتهية .
• دراسة المطالبات المالية للمقاولين وتحضير الرد عليها .
• التوصية لاصدار شهادات اتمام العقد عند أنتها مدة الصيانة